Общая информация- Информация о сайте
На главной странице вы будете видеть сводную о вашем сайте. Это главное меню вебмастера. Из него сразу можно перейти к просмотру Страниц в поиске, Внешних ссылок на ваш сайт, просмотреть количество страниц загруженных роботом (Структура сайта), а так же перейти к изучению исключенных страниц. На главной обычно показывается график ошибок и предупреждений, а под графиком список и описание. Нормально, если внизу есть только ссылка на исключенные страницы. Как правило это страницы заблокированные в файле robots.txt

Индексирование сайта- Страницы в поиске
На этой вкладке вы можете изучить какие страницы находятся в индексе. Довольно часто информация на этой странице может немного запаздывать и не соответствовать реальному положению дел
Узнать точное количество страниц в индексе можно по этой ссылке Проверить сайт
Или ввести в поиск Яндекса следующую конструкцию host:vashsite.ru где vashsite.ru это адрес проверяемого сайта без http://

Входящие ссылки
Внешние ссылки - это список страниц, где робот Яндекса обнаружил ссылки на ваш сайт
Внутренние - это внутренние ссылочные связи ваших страниц на сайте

Исключенные страницы
По типу - на вкладке перечислены причины исключения страниц. Разделяется на замечания, информацию и ошибки. Каждый пункт кликабелен и можно перейти к просмотру списка исключенных страниц
По разделам - на вкладке указаны разделы сайта где были исключения страниц. Нажав на любой раздел вы получите информацию о причине исключения

История индексирования
Количество запросов - отчет сканирования сайта в графике, где зеленым цветом выводятся сами запросы, а красным и желтым ошибки подключения или ошибки DNS
HTTP коды - информация, которую получает робот при сканировании. Подробнее об пунктах вы можете унать по ссылке настройки

Настройка индексирования
Анализ robots.txt - на этой вкладке вы можете увидеть роботекст, который робот загрузил с вашего сайта, там же можно вызвать повторную загрузку и проверить отдельные адреса страниц сайта на запрет или разрешение в robots.txt - для этого надо ввести список интересующих вас страниц в форму Список URL и проверить
Файлы sitemap - вкладка, где можно добавить адреса sitemap.xml карты сайта в вебмастер, для этого нужно скопировать адреса в панели управления - поиск по сайту - получить адреса sitemap и вставить в форму добавления. Подробнее о картах сайта. Информация по проверке и загрузке карт сайта в вебмастере часто запаздывает и обновляется нерегулярно.
Главное зеркало - очень важный пункт настройки индексирования. Подробнее о Главном зеркале сайта

Поисковые запросы - раздел статистики по поисковым запросам, где можно изучать популярность и позиции в поисковом индексе тех или иных страниц сайта, а так же список запросов по которым ваш сайт был показан и количество переходов по этим запросам

География сайта- Регион сайта. Как правило сайты на uCoz не имеют региональной принадлежности и с помощью настройки редко когда удается добиться пересмотра регионалки. Если вы считаете, что ваш сайт имеет ярко-выраженную региональную принадлежность и к нему прикреплен региональный домен например: kz или md, то вопросы пересмотра региональной принадлежности можно решить через тех. поддержку
Адреса и организации - если у вас коммерческий сайт или официальный сайт какой-либо организации, то вы можете с помощью этого пункта добавить информацию в справочник Яндекса

Содержимое сайта- Какие данные можно передать К сожалению до сих пор Оригинальные тексты доступны только сайтам с тИЦ 10 и выше

Сайт в результатах поиска - Быстрые ссылки. Это ссылки, которые будут выводиться под адресом страницы сайта в поисковой выдаче. Если ссылки определены, то вам будет предоставлен список ссылок которые можно подключить к показу, так же ссылки можно отключить. Следите за статистикой переходов (кликов) по тем или иным запросам. Если они превысят 200 за неделю, то вполне вероятно, что страница на которую идет больше всего кликов и будет определена в быстрые ссылки. Но и конечно улучшайте структуру сайта
Регистр имени сайта - вы можете настроить вывод названия сайта в поисковой выдаче

Безопасность
Если ваш сайт помечен в выдаче, как сайт который может нанести вред компьютеру, то на вкладке безопасность появится список страниц на которых при обходе роботом был замечен вредоносный или агрессивный код. Напротив каждой ссылки будет кнопка перепроверить и примерное описания причины блокировки. После удаления вредоносного кода нужно нажать на перепроверку. Если вы не можете справиться сами, то можете обратиться в тему Вирусы на сайтах

Служба поддержки - наверное это самый важный пункт в вебмастере. Через службу поддержки вы можете решить почти все вопросы. Этим вебмастер Яндекса выгодно отличается от инструментов для веб-мастеров Google
Если вы пишете в поддержку и выбираете заголовком сообщения один из предоставленных пунктов на выбор, то скорее всего вы получите автоматический ответ. В любом случае обращения в поддержку ваш сайт будет проверен "вручную" имейте это ввиду