1. Если вы ранее (до введения или включения функции) писали в своих сообщениях html (например форум дизайна), то после включения функции эти html теги в таких сообщениях не отразятся, а только в новых (те, что вы напишите после включения html). И наоборот, писали html, отключили функцию, всё написанное в html формате не пропадает.
2. Разрешать html теги в сообщениях опасно и лучше всего этой функцией пользоваться на время. Например, включите функцию только для группы Администраторы, оформите сообщение с использованием html как вы хотите и отключите функцию.

1. В сообщениях при включённой функции html можно использовать Информеры, которые прекрасно работают;
2. Полезно включить, если вы хотите дать название, описание для своей картинки или текста (теги alt, title);
3. Так же, полезно при составлении номерных списков, если первое значение не 1 (тег start);
4. Есть ещё безумный вариант для безумных людей, но вариант сказать должен. Если вам надо в определенных темах иметь разный вид такста в сообщениях, но вы не хотите заваливать шаблон или файл со стилями раличными группами, то можно в первом сообщении темы написать свой класс, например:

и сообщения писать так:

тогда весь ваш текст будет отражаться именно так как вы захотите только в этой теме. Все будут думать "как же он (она) пишет таким шрифтом, цветом? и т.п." Для удобства стиль можно назвать именем темы: и т.д. Не забываем сделать это сообщение "шапкой темы" иначе на новой странице темы стили работать не будут.
5. В общем, вы можете использовать любой html, я только лишь привел примеры.

1. Точно знаю, что опасным и рабочим может быть тег . С его помощью можно сделать пакости. (Не пишу как, но проверял).
2. Так же могут сделать неприятности с тегов если вставлять этот тег в первом сообщении страницы и последнем. Вся эта страница не бцдет индексироваться и ни кто знать не будет, так как сам тег не отобразится.
3. Ещё один нюанс с тегом переносом. Можно написать сообщение, ставить тег автопереноса и все посетители будут отправляться в указанную страничку. Например, кто-то напишет сообщение, вы посмотрите всё вроде "ок". Злоумышленник отредактирует сообщение, вставит код и все будут летать до тех пор, пока вы не заметите нововведенную дыру.
Я всего лишь привел малую часть примеров того, как могут пользователи использовать функцию "html в сообщениях". Выводы делайте сами.

1. Лучше всего тему с html создавать в отдельном форуме (подфоруме) который видите только вы. Если после создания вы удостоверились, что всё работает верно, смело переносите её в нужное место. Если какой-то сбой (особенно с тегами таблиц) и вы ни как не можете это исправить (мало ли), то можно через панель снести этот подфорум вместе с темой.
2. Перевод строки заменяется тэгом
по умолчанию.
3. Если то, что вы хотите сделать через html можно сделать с помощью вв-кодов, то лучше выбрать второе.